.CHIP Dosya Uzantısı Nedir?
CHIP dosyası, Gen Seti Zenginleştirme Analizi (GSEA) yazılımı tarafından kullanılan bir mikroarray açıklama dosyasıdır. Mikroarray özelliklerini (yani prob setlerini) gen sembolleri ve başlıklarıyla eşleştiren bir elektronik tablo içerir. CHIP dosyaları, bazı gen ifadesi veri dosyalarında bulunan sembol olmayan gen tanımlayıcılarını sembol tanımlayıcılara dönüştürmek için kullanılır.
Mikroarray Ek Açıklama Dosyası
.CHIP dosya formatı hakkında tablo halinde detaylı bilgiler yer almaktadır.
| Dosya Uzantısı | .CHIP |
|---|---|
| Uzantı Adı | Mikroarray Ek Açıklama Dosyası |
| İngilizce Adı | Microarray Annotation File |
| Geliştirici | GSEA Team |
| Dosya Türü | Elektronik Tablo Dosyaları |
| Format | Bilinmiyor |
Anahtar Kelimeler: chip, file, extension, format, Microarray Annotation File, spreadsheet, open, information, Mikroarray Ek Açıklama Dosyası
Daha Fazla Bilgi
GSEA, önceden tanımlanmış bir gen kümesinin biyolojik durumlar arasında istatistiksel olarak anlamlı, uyumlu farklılıklar gösterip göstermediğini belirlemek için kullanılan bir gen analiz programıdır. Bir analiz gerçekleştirirken, bilim insanları GSEA'ya bir gen ifadesi veri kümesi, ilgili örnek açıklamaları ve bir gen kümesi koleksiyonu dahil olmak üzere birkaç farklı veri türü yüklemelidir. Çoğu zaman, bilim insanları GSEA'yı Moleküler İmzalar Veritabanı'ndan (MSigDB) gen seti dosyaları ile kullanırlar. Bu dosyalar HUGO insan gen sembollerinden oluşur. Ancak, bazı gen ifadesi dosyaları başka türde tanımlayıcılar kullanır. Bir bilim insanı bu gen ifadesi dosyalarından biriyle karşılaşırsa, dosyanın tanımlayıcılarını MSigDB'nin gen seti dosyalarında bulunan insan sembollerine dönüştürmek için bir CHIP dosyası kullanmalıdır. Ancak o zaman analizlerini gerçekleştirebilirler. Bir CHIP dosyası hangi verileri içerir? CHIP dosyaları tipik olarak üç veri sütunu içeren elektronik tablolardır: Prob Seti Kimliği: Bir gen ifadesi veri dosyasında kullanılan gen sembolü olmayan tanımlayıcılar Gen Sembolü: Karşılık gelen gen sembolü tanımlayıcıları Gen Başlığı: İlgili gen başlıkları gen_symbol.chip dosyası ek bir sütun olan Takma Adlar içerir. Bu sütun, bir prob seti kimliği birden fazla gen sembolüyle eşleştirilebiliyorsa ek gen sembollerini içerir.
Bilişim Teknolojileri ve Uygulamalar
Bilişim teknolojisinin temel bilgilerini, olası hataları, terim ve kavramları keşfedin. Ayrıca hepsi tek bir yerde bulunan mac uygulamaları, yazılımları ve araçlarından oluşan seçkin koleksiyonumuzla sınırsız olanaklar dünyasına adım atın.